Este tratamento inclui:

- tanques biológicos, onde tem lugar, na presença de oxigénio, a degradação da matéria orgânica por meio de microorganismos aeróbios, assim como a dos nutrientes (Azoto e Fósforo); estes tanques serão divididos em duas zonas,
uma anóxica e uma aeróbia;

- recirculação do licor misto para realimentação da zona anóxica com iões nitrato a desnitrificar;

- decantadores secundários, para separação da água tratada e da biomassa das lamas biológicas, de modo a reutilizar a matéria viva, base da depuração.

- recirculação das lamas, de modo a realimentar os tanques biológicos com lamas biológicas; outro objectivo desta recirculação consiste na manutenção de um meio em que o rácio CBO5 admitido/massa de lamas biológicas nos tanques
corresponda à carga mássica de funcionamento